蝙蝠俠（邁克爾•基頓 Michael Keaton 飾）歸來了！自從打敗“小醜”后，高譚市獲得片刻的甯靜。然而，又一個強大的對手出現了！這次是脾氣乖張暴戾的“企鵝”。　　“企鵝”因為是次子，所以自幼就被父母遺棄，落下殘疾，導致“企鵝”對整個社會都心生不忿。長大后“企鵝”的企鵝決心殺回高譚市，将市内的長子都殺光，并控制整個高譚市。在迫使邪惡商人馬克斯（克里斯托弗•沃肯 Christopher Walken 飾）幫忙后，“企鵝”順利當上了高譚市長。同時，馬克斯的秘書西莉婭（米歇爾•菲佛 Michelle Pfeiffer 飾）意外獲知了他們的秘密，在遭受他們迫害時意外獲得了超強能力，成為了亦正亦邪的貓女。　　蝙蝠俠這次将面臨“企鵝”和貓女的雙重挑戰！