在與戈魯戈姆戰鬥後半年，本應取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝國打破。克萊西斯帝國的傑克将軍想拉攏南光太郎作為部下，但光太郎不答應，于是傑克将軍便将其變身機能破壞。變身機能破壞的情況下，光太郎被扔往宇宙。在即将變為宇宙塵埃的時候，光太郎被神秘的太陽光線照射，其體内的帝王石亦産生了變化，光太郎也因此變成了新生的光之王子·“太陽之子”假面騎士BLACKRX，并展開了與克萊西斯帝國的戰鬥。