這是一個忍者依舊活躍在舞台上的世界。然而和過去不同，如今的忍者多為富翁和政治家效力，幫助他們幹一些見不得人的勾當，這樣失去了信仰的忍者被稱為“惡忍”。為了對抗日益壯大的惡忍勢力，政府建立了半藏學院，將那裡作為培養“善忍”的地方。 天真活潑的焰（喜多村英梨 配音）、出身貧困卻有着格外堅韌的意志的詠（芽野愛衣 配音）、沉默寡言絲毫不表露任何感情的日影（白石涼子 配音）、看上去像個小孩其實對自己身材十分在意的未來（后藤沙緒里 配音）、腹黑狡猾但實際上充滿了母性光輝的春花（豐口惠美 配音），在學校里，這五名少女相遇了。