《神勇CID》乃是著墨於警務人員與黑社會的大鬥法，透過故事道出正與邪、善與惡的意義。故事首先交付二十年前劉炳堅與賈錫年運私貨，劉炳堅被捕，在外國服刑，留下子女三人給賈錫年撫養。身任沙展的劉振輝乃劉炳堅之二子，因女友馬思敏被毒販企圖槍殺，遵致失憶，悲痛之馀，決心追查主謀。另一方面，劉振輝之同事程進與江寶華自小青梅竹馬，但因程進過於大男人主義，故而江寶華便轉愛劉振輝，三個本為同僚的好友，遂牽涉進一段复雜的三角戀愛漩渦里。與此同時，賈鍚年之子賈若龍欲獨攬黑幫大權，與黑幫頭子張雄之情婦易海倫搭上關係，被張雄發現，含恨在心，而賈錫年知子不肖，大加責罵。　　賈若龍在此情勢下，為假裝清白，遂娶了劉振輝之妹麗瓊為妻，婚後依然與易海倫私會，劉振輝不滿，常代妹出頭，引起多次沖突。賈若龍野心勃勃，要進一步獲得黑幫勢力，便利用失意的程進達成目的，但在最後關頭，程進協助劉振輝，将賈若龍繩之以法；而劉振輝與江寶華的感情亦日益成熟，一對有情人終能成眷屬。